В центре функционируют 2 отделения
Каталогизация и редактирование. Основная задача отдела вести контроль библиографических записей, не допускать их повтора и обеспечить их качество. Отдел состоит из 6-ти специалистов.
Техническое обеспечение и внешние связи. Устанавливает активные связи между информационно-библиотечными учреждениями. Обеспечивает защиту базы СвЭК, включая архивирование записей, защиту от несанкционированного доступа и вирусов, дублирование в целях сохранности и т.д. Отдел состоит из 4-х специалистов.